E SPI e i2c é o que mais vais ver, maior parte dos sensores falam i2c, e um ou dois GPIO's para interrupts.
SPI tambem é comum, principalmente para DAC's e ADC's que precisam de um interface mais rápido.
Tens as UART para serial, que tipicamente suportam 8/9 bits e é meio comum suportarem alguns modos de IR, se meteres serial em cima de RS-485 tens o famoso DMX utilizado em iluminação profissional(aquelas luzes todas num palco de uma banda estão todas a falar DMX aka serial com a consola do VJ).
Tens CAN que é o standard de comunicação no mundo automovel, a centralina fala CAN com o painel de instrumentos, com os motores dos vidros, com sensores de estacionamento, com o rádio e com mais mil e quinhentas caixas espalhadas pelo carro actual.
Tens o simples e versatil interface paralelo, não é muito comum de se ver, mas tem sempre a sua utilidade, mais que não seja para adicionares SRAM ou memória a um micro com um interface externo(ou no caso de um 68k, Z80, e por ai fora interface paralelo é tudo o que tens e o que precisas para teres um sistema funcional).
PWM é por si só tambem um interface de comunicação, tens alguns sensores que têm saidas em PWM(um exemplo é encoders magnéticos da AMS em que tens uma saida de PWM com frequencia fixa e o duty cycle dá-te os dados).
USB Host/Device tambem é um interface e bem flexivel(podes ser um device e aparecer num pc como um teclado, um rato, um joystick, uma placa de som(com entrada e/ou saida), como uma porta serial, como bulk(tipo uma pen), e penso que tens mais uns quantos casos diferentes).
Tens micros com "meio" ethernet, e depois tens um interface onde ligas um PHY ethernet, isso usa um protocolo especifico que me escapa o nome agora.
Tens I2S que é um formato standard para ligar DAC's/ADC's para audio.
Da TI especificamente tens McASP/McBSP que são digamos que portas especificas para audio/dados serializados.
No mundo de FPGA's tens transceivers single-ended ou diferenciais que te permitem implementar desde uma porta serial a uma porta HDMI/DisplayPort ou um transmissor rádio e com muita coisa pelo meio.
E isto é só a ponta do iceberg.