Cansado de ver erros de mysql a deitarem o site a baixo e sem conseguir detectar a causa, finalmente migrei a base de dados para oura instancia para ver como correm as coisas.
A migração estava prevista ser feita toda de uma vez juntamente com o apache e com a criação do ssl para passarmos a usar https, mas acabei por antecipar a base de dados para ver se resolve o problema de perda de ligação à base de dados.
Com isto, agradecia que verificassem se o site parece de alguma forma instável ou mais lento, para que caso necessário possa fazer correcções ou rollback para o server de mysql antigo.
Esta instancia de mysql está praticamente de raiz e não vou fazer alterações de maior nas configurações para ver se não dá problemas, só mesmo o necessário.
Qualquer coisa ou se encontrarem o servidor em baixo por qualquer razão, enviem-me um email que eu assim que tiver acesso ao computador resolvo a situação.
Desculpem o incomodo, espero que tenha sido o último down-time do ano, de preferencia o último dos próximos anos
