Programar atmega 1284P com USBAsp e ver a porta serie por FTDI

[Kristey]

Ora ando aqui a aventurar-me com outros microcontroladores da atmega.

Não me importo de ter que programar isto sem a FTDI, mas estou a ter problemas em comunicar por serial.
Usando um programa simples ele comunica bem na primeira porta serie.

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Serial.println("Ola");
digitalWrite(13,HIGH);
delay(1000);
Serial.println("oi");
digitalWrite(13,LOW);
delay(1000);

O problema é quando faço upload de um programa que supostamente funcionava bem no atmega 328, e ao qual nada mudei, pelo menos podia dizer o Serial.println("connecting...") que tem no void setup, mas nem isso...
Está sempre caladinho

Posto isto nao consigo fazer debug...
Ainda comecei a ler umas coisas em de AVRdude, mas não consegui avançar muito nem solucionar o problema.

Alguém me pode ajudar?

[jm_araujo]

Que ambiente estás a usar?
Recompilaste?

[senso]

Convem, porque os registos da UART são diferentes.
Já programas-te os fuses?
Tens de desligar o clock div e activar full swing crystal oscillator 8Mhz - e 1k clocks +/-.

[Kristey]

Peço desculpa anda não ter escrito aqui, mas estive bastante aterrado nos últimos dias.

O ambiente que estou a usar é o IDE do Arduino.

Senso ainda tentei começar desta vez a programar tudo por mim sem o IDE do Arduino contudo o tempo que demoraria a desenvolver o projecto não me permite entregar isto a tempo e não iria ser avaliado.
Eu tenho um cristal de 16MHz para que tudo seja igual a um arduino normal.
A questão aqui é: se eu escrever um simples programa a falar um "olá" por série, como o que escrevi em cima, ele comunica bem (tem duas portas série, e ele comunica na primeira), ora pressuposto que ao fazer upload de um programa qualquer que tenha um serial print logo no setup, seria pressuposto que ele continua-se a falar na mesma :/

Posso fazer o que me estás a indicar, contudo preciso de um pouco mais de luzes?
É pelo avr rude que faço esses procedimentos?